医药洁净室设计规范有着自己特殊的要求，就是因为这样的洁净室涉及到了人身安全，因此在设计之中必须秉承安全、卫生、洁净的理念设计，综合考虑医药所处的地理位置及环境。
一、医药洁净厂房必须按其工艺流程及设备状况合理布局，由于医药洁净室内有着人流流动，那么主体结构要采用灵活性规范设计，必须考虑到布局结构紧凑性，而且还要考虑到洁净室药品可能引起的工艺流程变化及设备可能的更新。
二、我国地域极其广阔，地区温差大及日温差很大，因此医药洁净室选材很重要，要选择其气候条件，立足保温、隔热及防火、防潮材料性要求。
三、医药洁净室对建筑耐久性有着年限要求，建筑物主体结构要具备同建筑处理和室内装修水平相适宜的等级。两者必须协调。杜绝温度、沉陷可能对安全的影响，不能破坏建筑装修的完整性及气密性。
四、医药洁净室在建设的时候，如果技术夹道要设有检修门的时候，必须要面向非医药洁净区。如果必须面向医药洁净区之时，在其技术夹道内可设置吊顶，技术夹道内设计规范应按医药洁净区要求执行。
因此可以这么说，在实际操作中，医药洁净室设计规范必须要保证洁净度及安全性，这样的话才可以让其保持无菌性，尤其是手术室等场所更有着这样的要求，这样就保证了用药的安全，杜绝了可能的交叉感染，让人们就医环境更加安全、合理。
